一 。天然祖母绿的折光率一般在1.57－1.59之间，而合成祖母绿折光率一般小于1.57,较低，但也有例外的情况。
 
二 。天然祖母绿一般大于2.7，比重较大，而熔融法合成的祖母绿，比重只有2.65－2.66左右。但要注意的是，水热合成的祖母绿也有比重较高的。
 
三。 天然祖母绿大多会有瑕疵及三相包裹体，针状、柱状、粒状的结晶矿物包裹体等合成的祖母绿则往往比较干净，水热法合成的祖母绿包裹体，呈“窗纱状”，熔融法合成的祖母绿的包裹体呈面包屑状。天然与合成祖母绿的包裹体特征不同。
 
四 。天然祖母绿在紫外线下反应比较迟钝，呈暗红色；合成祖母绿则往往发强红色荧光。