蓝碧玺一般颜色偏深，偏暗，而海蓝宝石颜色呈淡蓝色，海蓝宝石颜色普遍较淡，那种蓝色是浅水处的的海水颜色或淡天蓝色，还有些海蓝宝石颜色偏绿呈浅蓝绿色。一般情况下蓝碧玺和海蓝宝石从颜色上就可以区分，但是当蓝碧玺的颜色也很浅时，它们之间就需要以其它特征来辅助鉴别了。
2.从包裹体来看
碧玺中的包裹体常为不规则线状空穴和扁平薄层空隙包裹体，其内常被液体充填，部分碧玺可含大量平行纤维状包裹体。而海蓝宝石内部的包裹体则是典型的雨状包裹体。一般品质较好的宝石上肉眼都不易看到包裹体，这就需要借助于放大镜，一般十倍的珠宝镜就可以。
3.从其它性状来看
碧玺具有多色性，而海蓝宝石也具有多色性。硬度两者相差也不明显。碧玺的密度要大于海蓝宝石，因而相同体积大小的宝石，蓝色碧玺要高于海蓝宝石。
