红色碧玺，颜色也可以是粉红，是由锰元素致色的。

其实，红色碧玺Rubellite和粉红色碧玺还是有所区别的，但却是个难题。一种观点是：Rubellite是碧玺交易中使用用来表示同一色系的一种，红色的，是用来区分不同颜色的碧玺，也就是说但凡有红色色调就是Rubellite。而另一种观点是，红色色调不单单只是红和粉红，还有很多，而冠名为Rubellite的红碧玺很少，所以Rubellite指的是有鲜艳红色色调有品质的碧玺，而Pink Tourmaline指粉红色调。市场上多以第二种为主。

绿色碧玺，颜色还包括黄绿，蓝绿，棕绿色，是由铬元素和钒元素致色的。

绿色碧玺中最好的就是翠绿色。刚开始在巴西发现绿色碧玺的时候，一度被认为发现的是祖母绿而欣喜若狂。如此纯净的祖母绿是前所未有的，所以被称为巴西祖母绿。之后，人们才认识到，这是不同的两种石头。所以绿碧玺还可以被俗称为巴西祖母绿。碧玺也常常被切割成阶梯型（祖母绿型）来凸显颜色。