不同颜色碧玺其相似宝石也不同，红色碧玺主要与粉红色黄玉、红色尖晶石、红柱石等相混，可以通过重液法鉴别。
用一瓶3．06S／cm3的重液几颗石头同时放人重液中红碧玺悬浮或慢慢下沉，而红色黄玉、红色尖晶石则迅速下沉，红柱石下沉速度也大于红碧玺，由此可以挑出红碧玺。绿碧玺主要易与橄榄石、绿色透辉石、绿色石榴石等相混。
由于碧玺有较大的双折率，在合适的位置可以观察到清晰的后刻面棱重影而石榴石没有。橄榄石与碧玺的内部包体明显不同，橄榄石中有特征的睡莲状包体而碧玺内含有典型的不规则线状和薄层空穴，部分碧玺可见大量平行纤维。碧玺为一轴晶在折射仪中两条阴影界线一条上下移动，另一条不动。而绿色透辉石两条阴影界线都可上下移动，而且透辉石折射率高于碧玺。
玻璃可以仿冒所有颜色的碧玺，通过偏光镜可发现玻璃为全暗，而碧玺为四明四暗显示为非均质体，观察玻璃仿冒品无论任何角度都不可能观察到后刻面棱重影。
碧玺还有一个与相似宝石不同的就是它的热电性。在碧玺受热、摩擦或太阳的辐照下，其表面会带有电荷。这些电荷对空气中的异性电荷有相吸性，能吸附空气中带异性电荷的灰尘、纸屑等。这是碧玺独有的特性。可以通过这种方法做简单的测试。
